banner
Центр новостей
Великолепный вид

Исследование различий в чувствительности штаммов Campylobacter jejuni к УФ-излучению

Jan 28, 2024

Том 13 научных докладов, номер статьи: 9459 (2023) Цитировать эту статью

Подробности о метриках

Campylobacter jejuni остается высоким приоритетом общественного здравоохранения во всем мире. Технология ультрафиолетовых светодиодов (UV-LED) в настоящее время исследуется для снижения уровня Campylobacter в пищевых продуктах. Однако возникли такие проблемы, как различия в чувствительности видов и штаммов, влияние повторных УФ-обработок на бактериальный геном и возможность стимулировать перекрестную противомикробную защиту или индуцировать образование биопленок. Мы исследовали чувствительность восьми клинических и фермерских изолятов C. jejuni к воздействию УФ-светодиодов. УФ-свет с длиной волны 280 нм вызывал различную кинетику инактивации среди штаммов, из которых три показали снижение более 1,62 log КОЕ/мл, тогда как один штамм был особенно устойчив к УФ-свету с максимальным снижением 0,39 log КОЕ/мл. Однако инактивация была снижена на 0,46–1,03 log КОЕ/мл у этих трех штаммов и увеличилась до 1,20 log КОЕ/мл у устойчивого изолята после двух повторных циклов УФ-излучения. Геномные изменения, связанные с воздействием УФ-излучения, анализировали с помощью WGS. Также было обнаружено, что у штаммов C. jejuni с измененными фенотипическими реакциями после воздействия УФ-излучения наблюдаются изменения в образовании биопленок и чувствительности к этанолу и очистителям поверхностей.

Кампилобактерии виды. в настоящее время являются одними из наиболее распространенных патогенов пищевого происхождения и, по оценкам, ежегодно связаны с примерно 500 миллионами случаев кампилобактериоза во всем мире. В большинстве случаев возбудителем считается Campylobacter jejuni1. Мясо птицы часто (60–80%) контаминировано Campylobacter spp. и считается основным источником инфекции у людей. Крупномасштабное производство птицы способствовало распространению C. jejuni среди стад, что привело к высокому уровню этой бактерии в мясе птицы, продаваемом в розничной торговле. Следовательно, на уровне ферм и переработчиков были предприняты усилия по сокращению количества C. jejuni в мясе птицы. Несколько вмешательств, таких как противомикробные препараты, вакцины, горячая вода и обработка туш паром, были изучены как потенциальные вмешательства в цепочку производства птицы2.

Ультрафиолетовый (УФ) свет стал потенциальной технологией дезинфекции благодаря своей эффективности в микробном обеззараживании поверхностей, воды и воздуха. Применение этой нетермической технологии для обработки жидких пищевых продуктов и поверхностей пищевых продуктов также оценивалось в агропродовольственном секторе с целью дальнейшего внедрения в пищевую цепочку3. УФ-свет расположен в определенном диапазоне длин волн 100–400 нм в электромагнитном спектре, где было показано, что область 200–280 нм, также известная как УФ-С, оказывает максимальный эффект инактивации для широкого спектра микроорганизмов. . Механизмы действия УФ-С хорошо описаны в литературе4,5 и включают образование димеров в ДНК, таких как циклобутан-пиримидиновые димеры (CPD) и пиримидин-6-4-пиримидоновые фотопродукты (6-4PP), которые приводят к повреждениям. Эти поражения препятствуют транскрипции РНК и репликации ДНК, нарушая нормальную функцию клетки и приводя к ее гибели3,4.

Для генерации УФ-излучения в промышленности широко используются ртутные ламповые устройства. Однако ртуть представляет собой токсичную угрозу, которая может оказать воздействие на людей и окружающую среду. Поэтому в последние годы для решения этой проблемы появились другие альтернативы, такие как технология УФ-светодиодов (UV-LED). УФ-светодиоды имеют другие преимущества по сравнению с ртутными лампами, такие как, среди прочего, низкая стоимость, высокая долговечность, низкое тепловыделение и энерговыделение, а также гибкость. Несмотря на это, эти новые устройства требуют дальнейшего изучения на предмет их потенциального применения в качестве стратегии дезинфекции в агропродовольственном секторе5,6.

По мнению Альвареса-Ордонеса и др.7, новые технологии обработки, используемые для обеззараживания пищевых продуктов, такие как ультрафиолетовое излучение, могут вызвать адаптивную реакцию у некоторых бактерий и привести к образованию более устойчивых клеток из-за характерной для стресса сублетальности. Таким образом, эффективность дезинфекции может снизиться после нескольких обработок по одной и той же технологии7. В частности, было документально подтверждено, что на обработку ультрафиолетом влияют скорость роста микробов, оптические свойства матрицы, а также микробные штаммы и видовые различия. Последнее может иметь значение при оценке эффективности УФ-излучения, когда высокая вариабельность устойчивости к УФ-излучению показана у штаммов одного и того же вида8. Например, Хотон и др.9 наблюдали значительные различия в кинетике инактивации 10 штаммов Campylobacter при применении УФ-лампы и УФ-светодиодов. Другое исследование также выявило различную восприимчивость штаммов Listeria monocytogenes, подвергавшихся воздействию УФ-излучения, однако фаза роста не влияла на восприимчивость10. Данные о специфической для штамма изменчивости устойчивости к ультрафиолетовому излучению позволяют предположить, что для понимания этого явления и поддержки будущих перспектив внедрения УФ-светодиодов требуется больше информации11. Существуют и другие проблемы, связанные с использованием этой технологии, включая влияние повторной УФ-обработки на восприимчивость бактериальных клеток, образование биопленок и/или совместный отбор для снижения чувствительности к дезинфицирующим средствам. Хотя связь между образованием биопленки и устойчивостью к УФ-излучению в бактериальных клетках после воздействия УФ-излучения недостаточно изучена, было показано, что устойчивость к УФ-излучению оказывает перекрестное защитное действие против таких стрессоров, как этанол, кислота, тепло и перекись водорода. Однако исследований, оценивающих этот феномен перекрестной защиты, недостаточно, чтобы сделать какие-либо однозначные выводы7,10,11,12.

 10%) and low quality reads with a Qscore below or equal to 5 (Qscore ≤ 5) in a 50% of the total bases were removed. After cleaning, the quality of the reads was evaluated with FastQC (v0.11.8) in combination with MultiQC (v1.9) programs44,45. Before proceeding any further, the identification of the strains was carried out with Kraken 2 (v2.0.7 beta) through the standard Kraken 2 database46. Assembly of reads to contigs and scaffolds was performed using SPAdes (v3.13.0) with the –careful option. The quality of scaffolds was assessed through QUAST (v5.1.0) and MultiQC45,47,48. To visualise the pangenome of the studied C. jejuni strains, anvi’o (v7.1) workflow was employed in the obtained assembled scaffold.fasta files of non-treated and treated strains (https://merenlab.org/2016/11/08/pangenomics-v2/; accessed on 23 November 2022)49. The former files were converted into anvi’o contig databases through the ‘anvi-gen-contigs-database’ program. After this step, identification of genes in scaffolds was performed with Prodigal in order to detect open reading frames and their annotation was conducted using the NCBI's Clusters of Orthologous Groups database (‘anvi-run-ncbi-cogs’ program)50,51 towards four HMM profiles of anvi’o provided by hidden Markov models (‘anvi-run-hmms’ program). In order to build the pangenome, similarities of the amino acid sequence were determined and compared within all genomes with NCBI blastp. Minbit heuristics of 0.552 were employed to eliminate weak matches between amino acid sequences and the MCL algorithm (‘anvi-pan-genome’ program)53 was used to identify clusters./p> 1,"+++++", X > 0.8, "++++", X > 0.6, "+++", X > 0.3, "++", X > 0.1, "+", H90 < 0.1, "−", where X is the optical density (OD) at 600 nm./p>